对于工作复杂的微生物实验室，其核心实验区内部还需进一步细化，实现从“一般操作”到“高危操作”的分级管理。
| 子分区 | 具体活动 | 环境与安全控制要求 |
|---|---|---|
| 普通操作区 | 样本接收、登记、涂片染色、显微镜观察、自动化仪器分析（如血培养仪、鉴定药敏仪）。 | 常压或微负压。良好的一般通风。仪器区域需稳定电源。 |
| 无菌/无菌操作区 | 无菌样品（如体液、组织）的接种、培养基倾注、菌种转接。 | 局部百级净化。在Ⅱ级生物安全柜或超净工作台内进行。房间整体可为万级背景。 |
| 病原体操作区（高危区） | 操作已知或疑似的高致病性或高传染性病原体（如结核分枝杆菌、布鲁氏菌）。 | 必须在Ⅱ级B2型（全排）或Ⅲ级生物安全柜内进行。该区域应设计为负压，并考虑独立的排风系统。 |
| 真菌/过敏原操作区 | 处理大量真菌孢子或可能产生气溶胶的操作。 | 强烈建议独立分隔，保持负压，采用垂直层流生物安全柜，排风需经高效过滤。 |
